Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms