Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Trabd2bB1ATG9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Trabd2bB1ATG9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Trabd2bB1ATG9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Trabd2bB1ATG9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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