Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spocd1B1ASB6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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