Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slfn8B1ARD8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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