Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms