Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms