Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Gm5538W4VSP6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5538W4VSP6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm5538W4VSP6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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