Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms