Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PdfS4R2K0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms