Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ubl3Q9Z2M6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ubl3Q9Z2M6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ubl3Q9Z2M6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ubl3Q9Z2M6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ubl3Q9Z2M6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms