Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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