Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms