Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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