Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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