Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms