Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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