Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms