Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chaf1aQ9QWF0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chaf1aQ9QWF0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chaf1aQ9QWF0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chaf1aQ9QWF0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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