Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dkk3Q9QUN9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms