Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms