Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Tlr5Q9JLF7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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