Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms