Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms