Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms