Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms