Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms