Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms