Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms