Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp29Q9ES63 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Usp29Q9ES63 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms