Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tfcp2Q9ERA0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms