Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Capn12Q9ER56 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Capn12Q9ER56 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Capn12Q9ER56 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms