Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms