Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sil1Q9EPK6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sil1Q9EPK6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms