Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r54Q9EPB8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r54Q9EPB8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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