Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpr88Q9EPB7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpr88Q9EPB7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms