Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnft1Q9DCN7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnft1Q9DCN7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnft1Q9DCN7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnft1Q9DCN7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnft1Q9DCN7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnft1Q9DCN7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnft1Q9DCN7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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