Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms