Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf6Q9DBU5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf6Q9DBU5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Rnf6Q9DBU5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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