Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms