Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chmp2aQ9DB34 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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