Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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