Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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