Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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