Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms