Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms