Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trim42Q9D2H5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trim42Q9D2H5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trim42Q9D2H5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim42Q9D2H5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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