Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1lQ9D1E5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms