Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms