Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 513.4 ms