Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms